يقوم المعهد بتوفير بعض الخدمات الصحية للطلاب مثل:
- التعاقد مع مستشفي الشروق العام بمدينة الشروق وذلك لعلاج الحالات الطارئة مجانا.
- تغطية تكلفة العمليات الكبيرة لبعض الطلاب بالمستشفيات.
- الطلاب الذين يعانون من مرض السكري و أي أمراض مزمنة تحتاج للعلاج علي نفقة الدولة يتم توجيهم وإعطائهم بيان بذلك.
- يوجد بالمعهد عيادات طبية لعلاج الحالات الطارئة والجروح اليومية (المتعامل معها جراحيا) و إعطائهم العلاج اللازم.
- عمل بعض التحاليل مثل السكر العشوائي السريع للطلاب المرضي.
- إعتماد الأجازات المرضية للطلاب وتوجيهم.
- يوجد سيارة إسعاف مجهزة بكل ما يلزم لنقل الحالات الحرجة من الطلاب للمستشفيات.
- يوجد كرسي طبي بكل عيادة طبية لنقل الطلاب المصابين من أماكنهم.
يقوم الطالب بإبلاغ العيادة التابع لها قسمة عن طريق أحد الزملاء مع احضار المستندات الازمة (فحوصات مثل التحاليل والأشعة وروشته الكشف الخارجي من طبيب مع أجازة مرضية محددة التاريخ والمدة) وتكتب له الأجازة المرضية بعد الموافقة من العيادة على نموذج مخصص يملأ من ش – ط وترسل إلى السيد وكيل المعهد لإعتمادها بعد الموافقة عليها من مدير ش . طبيه ثم ترسل إلى ش . ط ويسلم الطالب صورة منها
يحضر الموظف مايفيد بمرضه سواء كشف في عيادات الأكاديمية أو كشف خارجي بالمستشفيات التابعه أو أماكن خاصة مع إحضار المستندات الدالة على ذلك يتم إبلاغ القسم التابع له ش . ع من بداية المرض في حينه يتم إعتماد الأجازة المرضية عن طريق العيادة وإرسالها إلى ش . ع إذا تم الموافقة عليها .
في حالة عدم إعتماد الإدارة الطبية للأجازة تحتسب غياب وكذلك إذا لم يبلغ الموظف عن مرضه في خلال إسبوع من تاريخ المرض الأجازة المرضية التي يحصل عليها الموظف نتيجة إصابه عمل لا يتم التصديق عليها إلا بعد عمل محضر بالواقعة داخل محل العمل وطبقا للقواعد المتبعه بالمعهد